ในยุคโบราณ ห้องน้ำมักจะเป็นส้วมหลุมที่ขุดฝังกลบในดิน ซึ่งต้องแยกออกจากตัวบ้านเพื่อป้องกันกลิ่นและเชื้อโรคไม่ให้เข้าไปปะปนในบ้าน การแยกห้องน้ำออกไปนอกบ้านจึงเป็นวิธีที่ใช้กันทั่วไป
เมื่อเทคโนโลยีพัฒนาขึ้น การจัดการเรื่องห้องน้ำก็มีความสะดวกสบายมากขึ้น การระบายอากาศในห้องน้ำไม่ถือเป็นปัญหาในหลักฮวงจุ้ยหากห้องน้ำจะต้องตั้งอยู่ในตัวบ้าน
ห้องน้ำเป็นสถานที่สำหรับทำความสะอาดร่างกายและขับถ่าย ซึ่งมักมีความชื้นสูง จึงควรมีการระบายอากาศที่ดีและให้แสงแดดส่องถึงเพื่อฆ่าเชื้อโรคและลดความชื้นในห้องน้ำ
หากประตูห้องน้ำตรงกับเตียงนอน ความชื้นจากห้องน้ำอาจทำให้บุคคลที่นอนอยู่ตรงนั้นรู้สึกไม่สบายและอาจนำไปสู่ปัญหาสุขภาพในระยะยาว
การมีห้องน้ำในห้องนอนไม่ถือว่าเป็นสิ่งผิด แต่ควรแยกสัดส่วนอย่างชัดเจน และห้องน้ำควรมีช่องระบายความชื้นและได้รับแสงแดดอย่างเพียงพอ เพื่อป้องกันไม่ให้ความชื้นส่งผลเสียต่อสุขภาพของบุคคลในห้องนอน